Đại hội đã nghe và thảo luận Báo cáo kết quả công tác Đoàn và phong trào thanh niên năm 2006 - 2007 và kiểm điểm hoạt động của BCH Đoàn Thanh niên; quyết định nhiệm vụ trọng tâm công tác Đoàn và phong trào thanh niên nhiệm kỳ 2007 - 2012.
Trong nhiệm kỳ vừa qua, Đoàn thanh niên KTNN đã có sự phát triển và lớn mạnh về nhiều mặt từ cơ cấu tổ chức, số lượng đoàn viên đến nội dung và hình thức hoạt động, cơ bản hoàn thành các chỉ tiêu mà Nghị quyết Đại hội khóa V đã đề ra. Đoàn thanh niên KTNN đã chuyển giao từ trực thuộc Quận đoàn Ba Đình sang trực thuộc Đoàn khối I cơ quan Trung ương (nay là Đoàn khối các cơ quan Trung ương) và ngày 12/3/2007, Đoàn thanh niên KTNN được nâng cấp thành tổ chức đoàn cơ sở tương đương cấp quận, huyện. Hiện nay, Đoàn thanh niên KTNN đã hoạt động thống nhất trong toàn ngành với 18 Chi đoàn, trong đó có 17 Chi đoàn cơ sở và 01 Chi đoàn trực thuộc với 455 đoàn viên, thanh niên trong đó có 113 đồng chí là đảng viên; tuổi bình quân của đoàn viên, thanh niên là 28 tuổi. Phong trào đoàn đã phát triển rộng khắp ở các Chi đoàn, chất lượng hoạt động đã bước đầu đi vào chiều sâu và có trọng tâm, được Đảng ủy, lãnh đạo KTNN và Đoàn cấp trên ghi nhận.
Đại hội đã xác định mục tiêu chung trong nhiệm kỳ 2007 - 2012 là : Học tập và làm theo lời Bác; nâng cao nhận thức chính trị tư tưởng, củng cố cơ cấu tổ chức Đoàn; xung kích vào những khâu yếu, việc khó trong mọi hoạt động của KTNN; hoàn thành xuất sắc nhiệm vụ chuyên môn được giao, tăng cường trau dồi đạo đức và nâng cao bản lĩnh nghề nghiệp; đẩy mạnh công tác học tập, nghiên cứu; phát huy các hoạt động phong trào; lập thành tích chào mừng kỷ niệm 15 năm ngày thành lập ngành.
Phát biểu chỉ đạo tại Đại hội, đ/c Vương Đình Huệ, Bí thư Đảng ủy, Tổng KTNN nhấn mạnh: Nhiệm vụ đặt ra cho KTNN nói chung và Đoàn thanh niên trong những năm tới rất nặng nề, đòi hỏi mỗi cán bộ, công chức, viên chức và đoàn viên, thanh niên của KTNN phải nêu cao tinh thần trách nhiệm, khắc phục khó khăn, phấn đấu hoàn thành tốt mọi nhiệm vụ được giao, góp phần xây dựng KTNN ngày càng lớn mạnh, hoàn thành xuất sắc nhiệm vụ được Đảng, nhà nước giao. Mọi hoạt động của tổ chức Đoàn đều phải bám sát mục tiêu xây dựng KTNN thành cơ quan kiểm tra tài chính công có uy tín và có trách nhiệm, bám sát định hướng của ngành, từng bước chuyên nghiệp hóa, chính quy và hiện đại hóa, nâng cao hiệu lực pháp lý và chất lượng kiểm toán nhà nước như một công cụ mạnh của nhà nước. Đồng thời, hoạt động đoàn phải hòa chung với phong trào của tuổi trẻ thủ đô và phong trào của Đoàn khối các cơ quan Trung ương. Đồng chí yêu cầu BCH và các Chi đoàn tổ chức cho đoàn viên, thanh niên tiếp tục quán triệt, học tập Nghị quyết của Đảng ủy, coi đó là định hướng lãnh đạo của Đảng ủy về hoạt động của Đoàn thanh niên trong nhiệm kỳ mới.
Sau quá trình làm việc khẩn trương và nghiêm túc, Đại hội đã tín nhiệm bầu ra BCH mới khóa VI nhiệm kỳ 2007 - 2012 với 21 đồng chí./.